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乐鱼2022网址专家研究揭示非编码RNA在苹果不同组织中的表达特性

 

近日,乐鱼2022网址苹果资源与育种创新团队苹果资源课题组研究揭示非编码RNA在苹果根系、韧皮部、叶片、花和果实中的表达特性,揭示通过结合mdm-miR482可在苹果不同组织中具抗逆作用的多个lncRNA和circRNA,发现circRNA: Chr00:18744403|18744580通过与mdm-miR16相互作用可参与花器官的形态建成和着色;lncRNA:MSTRG.60895.2可作为mdm-miR393的模拟靶标调控MD17G1009000的表达,它可能在苹果果实的花青素代谢中具重要作用。相关成果发表在《基因(Genes)》和《国际分子科学(International Journal of Molecular Sciences)》上。

非编码RNA作为近年来的研究热点,可直接调控mRNA的表达,亦可通过结合miRNA进而调控mRNA的表达,在植物的形态建成、生物和非生物逆境中具重要的调控作用。

该研究从苹果5个主要组织中鉴定得到6495个circRNA和9440个lncRNA,获得不同组织中特异表达的lncRNA和circRNA,通过功能预测,miRNA靶位点预测等手段,获得特异表达lncRNA和circRNA在组织的特异表达特性和功能,以上结果为非编码RNA在苹果不同组织的功能解析奠定了基础。

原文标题:Expression Characteristics in Roots, Phloem, Leaves, Flowers and Fruits of Apple circRNA


 

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